由于按營(yíng)業(yè)稅全額征收營(yíng)業(yè)稅，未實(shí)行稅款抵扣制度，營(yíng)業(yè)稅納稅人購進(jìn)的貨物和增值稅應稅勞務(wù)所負擔的增值稅就無(wú)法作為進(jìn)項稅額進(jìn)行抵扣，納稅人因此承擔了該部分的增值稅，導致增值稅抵扣鏈條的中斷。同時(shí)，增值稅進(jìn)項稅額不能抵扣，營(yíng)業(yè)稅又以全額計征，無(wú)疑是對同一課稅對象既征收增值稅又征收營(yíng)業(yè)稅，造成了重復征稅。

　　同樣由于按營(yíng)業(yè)額全額征收營(yíng)業(yè)稅，分工越細，稅負越重；交通運輸業(yè)初期固定資產(chǎn)投入較大，由于這些外購固定資產(chǎn)均無(wú)法抵扣增值稅進(jìn)項稅金，導致企業(yè)承受增值稅和營(yíng)業(yè)稅的雙重負擔；外購服務(wù)的營(yíng)業(yè)稅不能抵扣，導致使用外包服務(wù)的成本較高，從而限制了服務(wù)外包的發(fā)展等，對行業(yè)的專(zhuān)業(yè)化發(fā)展和資源的優(yōu)化配置產(chǎn)生不利影響。

　　為此國家頒布了《交通運輸業(yè)和部分現代服務(wù)業(yè)營(yíng)業(yè)稅改征增值稅試點(diǎn)實(shí)施辦法》等系列規定，2012年1月1日起施行。將營(yíng)業(yè)稅改征增值稅的意義在于“有利于完善稅制，消除重復征稅；有利于社會(huì )專(zhuān)業(yè)化分工，促進(jìn)三次產(chǎn)業(yè)融合；有利于降低企業(yè)稅收成本，增強企業(yè)發(fā)展能力”。同時(shí)強調“營(yíng)業(yè)稅改征增值稅是一項重要的結構性減稅措施。根據規范稅制、合理負擔的原則，通過(guò)稅率設置和優(yōu)惠政策過(guò)渡等安排，改革試點(diǎn)行業(yè)總體稅負不增加或略有下降。對現行征收增值稅的行業(yè)而言，無(wú)論在上海還是其他地區，由于向試點(diǎn)納稅人購買(mǎi)應稅服務(wù)的進(jìn)項稅額可以得到抵扣，稅負也將相應下降。”

　　物流企業(yè)剛開(kāi)始普遍視這項改革為減稅措施，但實(shí)際是這項稅改讓物流企業(yè)喜憂(yōu)參半。

　　新稅改的內容對所有物流企業(yè)一視同仁，為什么物流行業(yè)里卻有人歡喜有人憂(yōu)呢？這要從不同的物流企業(yè)自身特征來(lái)講。自開(kāi)票納稅人還是代開(kāi)票納稅人，一般納稅人還是小規模納稅人，服務(wù)中外包的比重，會(huì )計處理和稅務(wù)籌劃是否得到更新等等，這些都會(huì )影響你在新稅法實(shí)施下的稅負情況。

　　影響納稅額的主要因素為稅率和稅基。

　　按照營(yíng)業(yè)稅征收辦法，物流企業(yè)主要涉及交通運輸業(yè)3%和服務(wù)業(yè)5%兩檔稅率�！蛾P(guān)于試點(diǎn)物流企業(yè)有關(guān)稅收政策問(wèn)題的通知》規定：試點(diǎn)企業(yè)將承攬的運輸、倉儲業(yè)務(wù)分給其他單位并由其統一收取價(jià)款的，應以該企業(yè)取得的全部收入減去付給其他合作方的余額為營(yíng)業(yè)額計算征收營(yíng)業(yè)稅。因此對于所提供服務(wù)中交通運輸業(yè)比重較大的企業(yè)，平均稅率較低；外包業(yè)務(wù)較多的企業(yè)，計稅基礎較少；申請試點(diǎn)物流企業(yè)后享受倉儲業(yè)的差額納稅，綜合稅負相對更低。除此以外的其他貨代、倉儲等服務(wù)業(yè)和代開(kāi)票納稅人由于不能抵減，稅負較重。

　　本次稅改“按照試點(diǎn)行業(yè)營(yíng)業(yè)稅實(shí)際稅負測算，陸路運輸、水路運輸、航空運輸等交通運輸業(yè)轉換的增值稅稅率水平基本在11％－15％之間，研發(fā)和技術(shù)服務(wù)、信息技術(shù)、文化創(chuàng )意、物流輔助、鑒證咨詢(xún)服務(wù)等現代服務(wù)業(yè)基本在6％－10％之間。為使試點(diǎn)行業(yè)總體稅負不增加，改革試點(diǎn)選擇了11％和6％兩檔低稅率，分別適用于交通運輸業(yè)和部分現代服務(wù)業(yè)”。

　　也就是說(shuō)在新稅改實(shí)施后，應稅服務(wù)年銷(xiāo)售額為500萬(wàn)元以上，或試點(diǎn)地區應稅服務(wù)年銷(xiāo)售額未超過(guò)500萬(wàn)元的原公路、內河貨物運輸業(yè)自開(kāi)票納稅人，即為一般納稅人，其稅率從原先的3%、5%調整為增值稅率：交通運輸業(yè)為11%，現代服務(wù)業(yè)為6%。

　　而小規模納稅人即年銷(xiāo)售額為500萬(wàn)元以下或非自開(kāi)票納稅人采取簡(jiǎn)易計稅方法，其稅率從5%降為3%或持平。

　　對于一般納稅人，增值稅是按照差額納稅，在稅率提升的同時(shí)若計稅基礎不變或上升，即意味著(zhù)稅負增加；若計稅基礎減少到足以彌補稅率上升，則企業(yè)稅負降低或沒(méi)有增加。那么計稅基礎究竟可以降低多少，取決于物流企業(yè)的進(jìn)項稅額。

　　在《實(shí)施辦法》第二十一條中規定，進(jìn)項稅額是指納稅人購進(jìn)貨物或者接受加工修理修配勞務(wù)和應稅服務(wù)，支付或者負擔的增值稅稅額，其中，準予從銷(xiāo)項稅額中抵扣的具體有：

　　1、從銷(xiāo)售方或者提供方取得的增值稅專(zhuān)用發(fā)票上注明的增值稅額。

　　2、從海關(guān)取得的海關(guān)進(jìn)口增值稅專(zhuān)用繳款書(shū)上注明的增值稅額。

　　3、購進(jìn)農產(chǎn)品，按照農產(chǎn)品收購發(fā)票或銷(xiāo)售發(fā)票上注明的農產(chǎn)品買(mǎi)價(jià)和13%的扣除率計算的進(jìn)項稅額。

　　4、接受交通運輸業(yè)服務(wù)，除取得增值稅專(zhuān)用發(fā)票外，按照運輸費用結算單據上注明的運輸費用金額和7%的扣除率計算的進(jìn)項稅額。

　　5、接受境外單位或者個(gè)人提供的應稅服務(wù)，從稅務(wù)機關(guān)或者境內代理人取得的解繳稅款的中華人民共和

　　國稅收通用繳款書(shū)上注明的增值稅額。但對于物流企業(yè)在實(shí)際業(yè)務(wù)中用于進(jìn)項抵扣的主要是第一條和第四條。

　　我們假設某自開(kāi)票B運輸公司，完全自營(yíng)，營(yíng)業(yè)稅改革后成為增值稅一般納稅人，企業(yè)從事運輸業(yè)務(wù)增值率為8%，某月?tīng)I業(yè)收入為100萬(wàn)，當月取得的進(jìn)項發(fā)票全部為增值稅專(zhuān)用發(fā)票，,占全部成本的20%，稅率為17%。

　�、鸥母锴癇為營(yíng)業(yè)稅納稅人，稅率為3%，則當期應納營(yíng)業(yè)稅額為100萬(wàn)×3%=3萬(wàn)。

　�、聘母锖驜為增值稅一般納稅人，適用稅率為11%，當期增值稅銷(xiāo)項稅額為100萬(wàn)÷（1+11%）×11%=9.91萬(wàn)；

　�、钱斊诔杀緸�100萬(wàn)÷(1+11%)÷(1+8%)=83.41萬(wàn)，

　�、饶軌蛉〉玫脑鲋刀愡M(jìn)項稅額83.41×20%×17%=2.84萬(wàn)；

　　企業(yè)當期應納增值稅額為9.91萬(wàn)-2.84萬(wàn)=7.07萬(wàn)。

　　改革后繳納的增值稅為7.07萬(wàn)元，遠大于改革前的營(yíng)業(yè)稅3萬(wàn)元。

　　假設取得的進(jìn)項發(fā)票全部為增值稅專(zhuān)用發(fā)票,占全部成本的40%，其他條件不變，針對營(yíng)業(yè)稅改革稅費分析:

　�、鸥母锴癇為營(yíng)業(yè)稅納稅人，稅率為3%，則當期應納營(yíng)業(yè)稅額為100萬(wàn)×3%=3萬(wàn)；

　�、聘母锖驜為增值稅一般納稅人，適用稅率為11%，

　　當期增值稅銷(xiāo)項稅額為100萬(wàn)÷（1+11%）×11%=9.91萬(wàn)；

　�、钱斊诔杀緸�100萬(wàn)÷(1+11%)÷(1+8%)=83.41萬(wàn)，

　　能夠取得的增值稅進(jìn)項稅額83.41×40%×17%=5.67萬(wàn)，

　�、绕髽I(yè)當期應納增值稅額為9.91萬(wàn)-5.67萬(wàn)=4.23萬(wàn)。

　　由此可見(jiàn)，當取得增值稅專(zhuān)用進(jìn)項發(fā)票占全部成本的比重從20%增加到40%時(shí)，其應納增值稅亦從7.07萬(wàn)元降低到4.23萬(wàn)元。進(jìn)項稅額的變化對最終的應繳稅費起到直接影響作用。

　　對于小規模納稅人，在新稅改的情況下使用簡(jiǎn)易計稅方法，稅率為3%。簡(jiǎn)易計稅方法的應納稅額，是指按照銷(xiāo)售額和增值稅征收率計算的增值稅額，不得抵扣進(jìn)項稅額。應納稅額計算公式：應納稅額=銷(xiāo)售額×征收率，不得進(jìn)行進(jìn)項抵扣�？紤]到稅改前物流企業(yè)涉及的倉儲業(yè)和代理業(yè)的稅率為5%，稅改后的小規模納稅人稅費將會(huì )有一定的減少。

　　假設某代開(kāi)票納稅人A運輸公司，完全自營(yíng)，無(wú)對外分包業(yè)務(wù)，營(yíng)業(yè)稅改革后，成為增值稅小規模納稅人，若某月?tīng)I業(yè)收入為10萬(wàn)，改革前A為營(yíng)業(yè)稅納稅人，稅率為3%，則當期應納營(yíng)業(yè)稅額為10萬(wàn)×3%=0.3萬(wàn)；

　　改革后A為增值稅小規模納稅人，適用3%征收率，由于增值稅為價(jià)外稅，則當期應納增值稅額為10萬(wàn)÷（1+3%）×3%=0.291萬(wàn)。

　　若上述A運輸公司營(yíng)業(yè)收入10萬(wàn)元中，有5萬(wàn)元應支付給其他承運方，由于不能抵減或抵扣，其納稅金額不變，改革前為0.3萬(wàn)；改革后為0.291萬(wàn)。

　　從以上的舉例可以看出，營(yíng)業(yè)稅個(gè)別行業(yè)試點(diǎn)改革不能簡(jiǎn)單地理解是增加還是降低稅負，稅負的變化要從企業(yè)自身的實(shí)際情況出發(fā)，分析企業(yè)全部的涉稅項目中與稅改有關(guān)的內容，進(jìn)行詳細測算，才能得出最后結論。